会社を設立するとメリットだけなら良いのですが、デメリットもあります。簡単に言うと、個人事業よりも経費はかかると言うことです。会計など色々な面で複雑になることが多くなります。会社の設立にとって一番不安な要素かもしれません。

１・税務

決算、税務申告、仕訳、個人事業では比べものにならないほど、面倒になってきます。　ほとんどの会社が税理士等に頼んでいます。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　ただ、経費を少しでも減らしたいなら、日々の仕訳等は会社で行って、決算だけ税理士等に依頼している会社もあります。もちろん、自社でやっている会社もあります。会社を設立すると必ず考えることでしょう。会社を設立する上でデメリットと言えるかもしれませんが、会社の信用度が上がることを考えれば仕方ないのかもしれません。

２・必要経費

会社を設立すると必要経費は間違いなく増えます。社会保険料の負担や通信費、保険料（労災、雇用）など。その分メリットもありますが、会社を設立すると経費が増えることは確かです。

３・財産の管理

個人事業と違って法人の場合は、個人の財産と法人の財産をきっちり分けなければなりませ ん。個人の財産のつもりで、法人名義の通帳から勝手に預金を引き出すことは問題です。ちなみに会社設立時に払込む資本金は、まず発起人名義の通帳に振込んで、会社の設立後に登記簿謄本等を金融機関に持参して会社名義の通帳を作り、その通帳に資本金を移します。ですから、会社設立登記前に会社名義の通帳は作ることができません。会社設立後に金融機関で会社を設立したという証拠（履歴事項証明書・定款等）を提出して法人名義の通帳を開設します。　　　　　　　　　　　　　　　　　

４・使用者責任　コンプライアンス

会社を設立して従業員を雇用すると、従業員の行動にも目を光らせなければなりません。人材次第で会社の命運を分けることになります。会社経営者は従業員の行動に対して知りませんでは済まされません。会社を設立すると使用者責任として連帯して責任を取らされることもあります。それと労働基準監督署などの法令を遵守しなければなりません。従業員が10人以上になると就業規則を作成して届出なければなりませんし、時間外労働や休日出勤などがある場合は３６協定という従業員と会社で話し合いを持ち、協議事項を届出なければならないのです。セクハラも気を付けないと大変なことにもなりかねません。このように会社を設立すると責任も大きくなりますが、同時に良い人材を集めて、法令を遵守すれば経営ではすごくプラスになります。